第1シーズンからのお馴染みのメンバーに加えて、新たにオタク嫌いなオタク少女・萩上千佳と、空気が読めない朽木学が加入した「現視研」。まずは日本最大の同人誌即売会「コミフェス」に参加するため、新会長の笹原を中心に同人誌を作ろうとするのだが……。いろいろと発生するイベントをクリアし、成長しながら、みんなが目指す目標に向かって進んでいく。
そんな愛すべきオタクたちの未来は！？